Der Aquarion, ein Mecha, ist die Waffe der Menschheit gegen die interstellare Bedrohung. Seit tausenden von Jahren trainierten menschlichen Piloten, um die Schattenengel, Monster mit kinetischer Energie zu besiegen. Und die Zeit ist gekommen: Wieder einmal braucht die Menschheit Aquarion. Das Schicksal der Erde steht erneut auf dem Spiel. Wird der Mecha ausreichen, um die Menschheit zu retten?